Гормондық терапияны ұзақ уақыт қолданғанда инсульт, сүт безі обыры, өт қабы аурулары және өкпе ісігінен өлім қаупі артады. Эстрогендік гормоналды терапияның өзі гормоналды терапияны 1-2 жыл қолданғаннан кейін веноздық тромбоздың қаупін арттырады: 1000-ға 2-ден 10-ға дейін әйел.