Кеден органдарындағы бақылау жүйесі келесі құрамдас бөліктерден тұрады: басқару механизмі, басқару құрылымы, басқару процесі және басқару жүйесін жетілдіру механизмі. Басқару механизмі – бұл: заңдар, принциптер, мақсаттар, әдістер және басқару функциялары.