Жүйелік әсер бауырдың, бүйректің, жүйке жүйесінің, қанның, жүрек-тамыр жүйесінің, иммундық жүйенің немесе ұрпақты болу жүйесінің зақымдануын қамтуы мүмкін. Кейбір ластаушы заттар канцерогенді (рак тудыратын), тератогенді (туа біткен ақауларды тудырады) немесе мутагенді (ДНҚ-ға әсер етеді) болуы мүмкін.