1598 жылы Федор Иванович патша мұрагер туралы бұйрық қалдырмай қайтыс болды. Шын мәнінде, қарсыластарын жойып, Борис Годунов Федор Иоаннович тұсында билеуші болды. Рюрик әулеті үзілгендіктен, Земский Собор Феодор қайтыс болғаннан кейін патшалыққа Борис Годуновты сайлады.