Қоңыржай орман зонасы қоңыр топырақты және ұнтақты-подзолды топырақтармен сипатталады. Қара топырақтар дала зонасында жиі кездеседі. Құрғақ далалар мен шөлейттерде каштан және қоңыр жартылай шөлді топырақтар жиі кездеседі. Биоклиматтық жағдайлар биіктікке қарай өзгеріп отырады, бұл топырақтардың тік зоналылығын тудырады.