Словакияда 4 мыңнан 5 мыңға дейін мұсылман тұрады, бірақ елде бірде-бір мешіт жоқ. Сонымен қатар, елде кейбір басқа христиандық конфессиялардың шағын топтары бар: баптистер, моравиялықтар, жетінші күн адвентистері, ескі католиктер, Словакияның апостолдық шіркеуі (Құдай жиналыстары), хуситтер және т.б.