Конфедерация үшін күрес үшін жаза ретінде рақымшылық жасалды, Ли, басқа конфедерациялар сияқты, АҚШ азаматының құқығынан айырылды. Бұл құқықтарды қалпына келтіру үшін Ли тапсырылғаннан кейін екі айдан кейін президентке кешірім беру туралы өтініш берді. Оның өтініші қанағаттандырусыз қалдырылды, ол құқықтары қалпына келмей қайтыс болды.