Сызықтық-функционалдық құрылым ұйым қызметінің ішкі және сыртқы параметрлері үнемі өзгеріп отыратын жағдайларға жарамайды. Осы жағдайларда оны пайдалану ақпарат ағындарының иррационалды таралуына, бақылауға қабілеттілік стандарттарынан асып кетуіне әкеледі, әсіресе аға менеджерлер арасында.