1999 жылға қарай Ельциннің рейтингі айтарлықтай төмендеді, денсаулығына байланысты проблемалар оның белсенді жұмыс істеуіне мүмкіндік бермеді. Осы себепті бірнеше үкімет басшыларын ауыстырған Ельцин өзінің мұрагері ретінде премьер-министр Владимир Путинді таңдады және 1999 жылы 31 желтоқсанда мерзімінен бұрын отставкаға кетті.